Pytorch之Dataset与DataLoader

打造你自己的数据集,源码阅读

Posted by CL on February 4, 2020

深度时代,数据为王。

PyTorch为我们提供的两个Dataset和DataLoader类分别负责可被Pytorhc使用的数据集的创建以及向训练传递数据的任务。如果想个性化自己的数据集或者数据传递方式,也可以自己重写子类。

Dataset是DataLoader实例化的一个参数,所以这篇文章会先从Dataset的源代码讲起,然后讲到DataLoader,关注主要函数,少细枝末节,目的是使大家学会自定义自己的数据集。

Dataset

什么时候使用Dataset

CIFAR10是CV训练中经常使用到的一个数据集,在PyTorch中CIFAR10是一个写好的Dataset,我们使用时只需以下代码:

data = datasets.CIFAR10("./data/", transform=transform, train=True, download=True)

datasets.CIFAR10就是一个Datasets子类,data是这个类的一个实例。

我们有的时候需要用自己在一个文件夹中的数据作为数据集,这个时候,我们可以使用ImageFolder这个方便的API。

FaceDataset = datasets.ImageFolder('./data', transform=img_transform)

如何自定义一个数据集

torch.utils.data. ataset 是一个表示数据集的抽象类。任何自定义的数据集都需要继承这个类并覆写相关方法。

所谓数据集,其实就是一个负责处理索引(index)到样本(sample)映射的一个类(class)。

Pytorch提供两种数据集:

  • Map式数据集
  • Iterable式数据集

Map式数据集

一个Map式的数据集必须要重写__getitem__(self, index),len(self) 两个内建方法,用来表示从索引到样本的映射(Map).

这样一个数据集dataset,举个例子,当使用dataset[idx]命令时,可以在你的硬盘中读取你的数据集中第idx张图片以及其标签(如果有的话);len(dataset)则会返回这个数据集的容量。

例子-1: 自己实验中写的一个例子:这里我们的图片文件储存在“./data/faces/”文件夹下,图片的名字并不是从1开始,而是从final_train_tag_dict.txt这个文件保存的字典中读取,label信息也是用这个文件中读取。大家可以照着上面的注释阅读这段代码。

from torch.utils import data
import numpy as np
from PIL import Image


class face_dataset(data.Dataset):
	def __init__(self):
		self.file_path = './data/faces/'
		f=open("final_train_tag_dict.txt","r")
		self.label_dict=eval(f.read())
		f.close()

	def __getitem__(self,index):
		label = list(self.label_dict.values())[index-1]
		img_id = list(self.label_dict.keys())[index-1]
		img_path = self.file_path+str(img_id)+".jpg"
		img = np.array(Image.open(img_path))
		return img,label

	def __len__(self):
		return len(self.label_dict)

下面我们看一下官方MNIST数据集的例子

class MNIST(data.Dataset):
    """`MNIST <http://yann.lecun.com/exdb/mnist/>`_ Dataset.
    Args:
        root (string): Root directory of dataset where ``processed/training.pt``
            and  ``processed/test.pt`` exist.
        train (bool, optional): If True, creates dataset from ``training.pt``,
            otherwise from ``test.pt``.
        download (bool, optional): If true, downloads the dataset from the internet and
            puts it in root directory. If dataset is already downloaded, it is not
            downloaded again.
        transform (callable, optional): A function/transform that  takes in an PIL image
            and returns a transformed version. E.g, ``transforms.RandomCrop``
        target_transform (callable, optional): A function/transform that takes in the
            target and transforms it.
    """
    urls = [
        'http://yann.lecun.com/exdb/mnist/train-images-idx3-ubyte.gz',
        'http://yann.lecun.com/exdb/mnist/train-labels-idx1-ubyte.gz',
        'http://yann.lecun.com/exdb/mnist/t10k-images-idx3-ubyte.gz',
        'http://yann.lecun.com/exdb/mnist/t10k-labels-idx1-ubyte.gz',
    ]
    raw_folder = 'raw'
    processed_folder = 'processed'
    training_file = 'training.pt'
    test_file = 'test.pt'
    classes = ['0 - zero', '1 - one', '2 - two', '3 - three', '4 - four',
               '5 - five', '6 - six', '7 - seven', '8 - eight', '9 - nine']
    class_to_idx = {_class: i for i, _class in enumerate(classes)}

    @property
    def targets(self):
        if self.train:
            return self.train_labels
        else:
            return self.test_labels

    def __init__(self, root, train=True, transform=None, target_transform=None, download=False):
        self.root = os.path.expanduser(root)
        self.transform = transform
        self.target_transform = target_transform
        self.train = train  # training set or test set

        if download:
            self.download()

        if not self._check_exists():
            raise RuntimeError('Dataset not found.' +
                               ' You can use download=True to download it')

        if self.train:
            self.train_data, self.train_labels = torch.load(
                os.path.join(self.root, self.processed_folder, self.training_file))
        else:
            self.test_data, self.test_labels = torch.load(
                os.path.join(self.root, self.processed_folder, self.test_file))

    def __getitem__(self, index):
        """
        Args:
            index (int): Index
        Returns:
            tuple: (image, target) where target is index of the target class.
        """
        if self.train:
            img, target = self.train_data[index], self.train_labels[index]
        else:
            img, target = self.test_data[index], self.test_labels[index]

        # doing this so that it is consistent with all other datasets
        # to return a PIL Image
        img = Image.fromarray(img.numpy(), mode='L')

        if self.transform is not None:
            img = self.transform(img)

        if self.target_transform is not None:
            target = self.target_transform(target)

        return img, target

    def __len__(self):
        if self.train:
            return len(self.train_data)
        else:
            return len(self.test_data)

    def _check_exists(self):
        return os.path.exists(os.path.join(self.root, self.processed_folder, self.training_file)) and \
            os.path.exists(os.path.join(self.root, self.processed_folder, self.test_file))

    def download(self):
        """Download the MNIST data if it doesn't exist in processed_folder already."""
        from six.moves import urllib
        import gzip

        if self._check_exists():
            return

        # download files
        try:
            os.makedirs(os.path.join(self.root, self.raw_folder))
            os.makedirs(os.path.join(self.root, self.processed_folder))
        except OSError as e:
            if e.errno == errno.EEXIST:
                pass
            else:
                raise

        for url in self.urls:
            print('Downloading ' + url)
            data = urllib.request.urlopen(url)
            filename = url.rpartition('/')[2]
            file_path = os.path.join(self.root, self.raw_folder, filename)
            with open(file_path, 'wb') as f:
                f.write(data.read())
            with open(file_path.replace('.gz', ''), 'wb') as out_f, \
                    gzip.GzipFile(file_path) as zip_f:
                out_f.write(zip_f.read())
            os.unlink(file_path)

        # process and save as torch files
        print('Processing...')

        training_set = (
            read_image_file(os.path.join(self.root, self.raw_folder, 'train-images-idx3-ubyte')),
            read_label_file(os.path.join(self.root, self.raw_folder, 'train-labels-idx1-ubyte'))
        )
        test_set = (
            read_image_file(os.path.join(self.root, self.raw_folder, 't10k-images-idx3-ubyte')),
            read_label_file(os.path.join(self.root, self.raw_folder, 't10k-labels-idx1-ubyte'))
        )
        with open(os.path.join(self.root, self.processed_folder, self.training_file), 'wb') as f:
            torch.save(training_set, f)
        with open(os.path.join(self.root, self.processed_folder, self.test_file), 'wb') as f:
            torch.save(test_set, f)

        print('Done!')

    def __repr__(self):
        fmt_str = 'Dataset ' + self.__class__.__name__ + '\n'
        fmt_str += '    Number of datapoints: {}\n'.format(self.__len__())
        tmp = 'train' if self.train is True else 'test'
        fmt_str += '    Split: {}\n'.format(tmp)
        fmt_str += '    Root Location: {}\n'.format(self.root)
        tmp = '    Transforms (if any): '
        fmt_str += '{0}{1}\n'.format(tmp, self.transform.__repr__().replace('\n', '\n' + ' ' * len(tmp)))
        tmp = '    Target Transforms (if any): '
        fmt_str += '{0}{1}'.format(tmp, self.target_transform.__repr__().replace('\n', '\n' + ' ' * len(tmp)))
        return fmt_str

Iterable式数据集

一个Iterable(迭代)式数据集是抽象类data.IterableDataset的子类,并且覆写了__iter__方法成为一个迭代器。这种数据集主要用于数据大小未知,或者以流的形式的输入,本地文件不固定的情况,需要以迭代的方式来获取样本索引。

关于迭代器与生成器的知识可以参见博主的另一篇文章Python迭代器与生成器介绍及在Pytorch源码中应用

这一块先mark着,因为还没有使用过。

DataLoader

Data loader. Combines a dataset and a sampler, and provides an iterable over the given dataset. –PyTorch Documents

一般来说PyTorch中深度学习训练的流程是这样的:

  1. 创建Dateset
  2. Dataset传递给DataLoader
  3. DataLoader迭代产生训练数据提供给模型

对应的一般都会有这三部分代码

# 创建Dateset(可以自定义)
    dataset = face_dataset # Dataset部分自定义过的face_dataset
# Dataset传递给DataLoader
    dataloader = torch.utils.data.DataLoader(dataset,batch_size=64,shuffle=False,num_workers=8 \)
# DataLoader迭代产生训练数据提供给模型
    for i in range(epoch):
        for index,(img,label) in enumerate(dataloader):
            pass

到这里应该就PyTorch的数据集和数据传递机制应该就比较清晰明了了。Dataset负责建立索引到样本的映射,DataLoader负责以特定的方式从数据集中迭代的产生 一个个batch的样本集合。在enumerate过程中实际上是dataloader按照其参数sampler规定的策略调用了其dataset的getitem方法。

参数介绍

先看一下实例化一个DataLoader所需的参数,我们只关注几个重点即可。

DataLoader(dataset, batch_size=1, shuffle=False, sampler=None,
           batch_sampler=None, num_workers=0, collate_fn=None,
           pin_memory=False, drop_last=False, timeout=0,
           worker_init_fn=None)

参数介绍:

  • dataset (Dataset) – 定义好的Map式或者Iterable式数据集。
  • batch_size (python:int, optional) – 一个batch含有多少样本 (default: 1)。
  • shuffle (bool, optional) – 每一个epoch的batch样本是相同还是随机 (default: False)。
  • sampler (Sampler, optional) – 决定数据集中采样的方法. 如果有,则shuffle参数必须为False。
  • batch_sampler (Sampler, optional) – 和 sampler 类似,但是一次返回的是一个batch内所有样本的index。和 batch_size, shuffle, sampler, and drop_last 三个参数互斥。
  • num_workers (python:int, optional) – 多少个子程序同时工作来获取数据,多线程。 (default: 0)
  • collate_fn (callable, optional) – 合并样本列表以形成小批量。
  • pin_memory (bool, optional) – 如果为True,数据加载器在返回前将张量复制到CUDA固定内存中。
  • drop_last (bool, optional) – 如果数据集大小不能被batch_size整除,设置为True可删除最后一个不完整的批处理。如果设为False并且数据集的大小不能被batch_size整除,则最后一个batch将更小。(default: False)
  • timeout (numeric, optional) – 如果是正数,表明等待从worker进程中收集一个batch等待的时间,若超出设定的时间还没有收集到,那就不收集这个内容了。这个numeric应总是大于等于0。 (default: 0)
  • worker_init_fn (callable, optional) – 每个worker初始化函数 (default: None)

dataset 没什么好说的,很重要,需要按照前面所说的两种dataset定义好,完成相关函数的重写。

batch_size 也没啥好说的,就是训练的一个批次的样本数。

shuffle 表示每一个epoch中训练样本的顺序是否相同,一般True。

采样器

sampler 重点参数,采样器,是一个迭代器。PyTorch提供了多种采样器,用户也可以自定义采样器。

所有sampler都是继承 torch.utils.data.sampler.Sampler这个抽象类。

关于迭代器的基础知识在博主这篇文章中可以找到Python迭代器与生成器介绍及在Pytorch源码中应用

class Sampler(object):
    # """Base class for all Samplers.
    # Every Sampler subclass has to provide an __iter__ method, providing a way
    # to iterate over indices of dataset elements, and a __len__ method that
    # returns the length of the returned iterators.
    # """
    # 一个 迭代器 基类
    def __init__(self, data_source):
        pass

    def __iter__(self):
        raise NotImplementedError

    def __len__(self):
        raise NotImplementedError

PyTorch自带的Sampler

  • SequentialSampler
  • RandomSampler
  • SubsetRandomSampler
  • WeightedRandomSampler

SequentialSampler 很好理解就是顺序采样器。

其原理是首先在初始化的时候拿到数据集data_source,之后在__iter__方法中首先得到一个和data_source一样长度的range可迭代器。每次只会返回一个索引值

class SequentialSampler(Sampler):
    # r"""Samples elements sequentially, always in the same order.
    # Arguments:
    #     data_source (Dataset): dataset to sample from
    # """
   # 产生顺序 迭代器
    def __init__(self, data_source):
        self.data_source = data_source

    def __iter__(self):
        return iter(range(len(self.data_source)))

    def __len__(self):
        return len(self.data_source)

参数作用:

  • data_source: 同上
  • num_samples: 指定采样的数量,默认是所有。
  • replacement: 若为True,则表示可以重复采样,即同一个样本可以重复采样,这样可能导致有的样本采样不到。所以此时我们可以设置num_samples来增加采样数量使得每个样本都可能被采样到。
class RandomSampler(Sampler):
    # r"""Samples elements randomly. If without replacement, then sample from a shuffled dataset.
    # If with replacement, then user can specify ``num_samples`` to draw.
    # Arguments:
    #     data_source (Dataset): dataset to sample from
    #     num_samples (int): number of samples to draw, default=len(dataset)
    #     replacement (bool): samples are drawn with replacement if ``True``, default=False
    # """

    def __init__(self, data_source, replacement=False, num_samples=None):
        self.data_source = data_source
        self.replacement = replacement
        self.num_samples = num_samples

        if self.num_samples is not None and replacement is False:
            raise ValueError("With replacement=False, num_samples should not be specified, "
                             "since a random permute will be performed.")

        if self.num_samples is None:
            self.num_samples = len(self.data_source)

        if not isinstance(self.num_samples, int) or self.num_samples <= 0:
            raise ValueError("num_samples should be a positive integeral "
                             "value, but got num_samples={}".format(self.num_samples))
        if not isinstance(self.replacement, bool):
            raise ValueError("replacement should be a boolean value, but got "
                             "replacement={}".format(self.replacement))

    def __iter__(self):
        n = len(self.data_source)
        if self.replacement:
            return iter(torch.randint(high=n, size=(self.num_samples,), dtype=torch.int64).tolist())
        return iter(torch.randperm(n).tolist())

    def __len__(self):
        return len(self.data_source)

这个采样器常见的使用场景是将训练集划分成训练集和验证集:

class SubsetRandomSampler(Sampler):
    # r"""Samples elements randomly from a given list of indices, without replacement.
    # Arguments:
    #     indices (sequence): a sequence of indices
    # """

    def __init__(self, indices):
        self.indices = indices

    def __iter__(self):
        return (self.indices[i] for i in torch.randperm(len(self.indices)))

    def __len__(self):
        return len(self.indices)

batch_sampler

前面的采样器每次都只返回一个索引,但是我们在训练时是对批量的数据进行训练,而这个工作就需要BatchSampler来做。也就是说BatchSampler的作用就是将前面的Sampler采样得到的索引值进行合并,当数量等于一个batch大小后就将这一批的索引值返回。

class BatchSampler(Sampler):
    #     Wraps another sampler to yield a mini-batch of indices.
    # Args:
    #     sampler (Sampler): Base sampler.
    #     batch_size (int): Size of mini-batch.
    #     drop_last (bool): If ``True``, the sampler will drop the last batch if
    #         its size would be less than ``batch_size``
    # Example:
    #     >>> list(BatchSampler(SequentialSampler(range(10)), batch_size=3, drop_last=False))
    #     [[0, 1, 2], [3, 4, 5], [6, 7, 8], [9]]
    #     >>> list(BatchSampler(SequentialSampler(range(10)), batch_size=3, drop_last=True))
    #     [[0, 1, 2], [3, 4, 5], [6, 7, 8]]

# 批次采样
    def __init__(self, sampler, batch_size, drop_last):
        if not isinstance(sampler, Sampler):
            raise ValueError("sampler should be an instance of "
                             "torch.utils.data.Sampler, but got sampler={}"
                             .format(sampler))
        if not isinstance(batch_size, _int_classes) or isinstance(batch_size, bool) or \
                batch_size <= 0:
            raise ValueError("batch_size should be a positive integeral value, "
                             "but got batch_size={}".format(batch_size))
        if not isinstance(drop_last, bool):
            raise ValueError("drop_last should be a boolean value, but got "
                             "drop_last={}".format(drop_last))
        self.sampler = sampler
        self.batch_size = batch_size
        self.drop_last = drop_last

    def __iter__(self):
        batch = []
        for idx in self.sampler:
            batch.append(idx)
            if len(batch) == self.batch_size:
                yield batch
                batch = []
        if len(batch) > 0 and not self.drop_last:
            yield batch

    def __len__(self):
        if self.drop_last:
            return len(self.sampler) // self.batch_size
        else:
            return (len(self.sampler) + self.batch_size - 1) // self.batch_size

多线程

num_workers 参数表示同时参与数据读取的线程数量,多线程技术可以加快数据读取,提供GPU/CPU利用率。

未来会出一篇文章讲一讲PyTorch多线程实现的原理。


以上